Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhodP97348 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RhodP97348 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RhodP97348 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RhodP97348 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RhodP97348 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RhodP97348 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RhodP97348 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RhodP97348 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RhodP97348 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RhodP97348 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RhodP97348 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms