Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mesp1P97309 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mesp1P97309 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms