Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sfrp2P97299 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sfrp2P97299 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms