Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabpb2P81069 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabpb2P81069 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabpb2P81069 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms