Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irx3P81067 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx3P81067 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx3P81067 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx3P81067 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx3P81067 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx3P81067 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx3P81067 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms