Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Ptprn2P80560 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ptprn2P80560 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ptprn2P80560 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ptprn2P80560 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ptprn2P80560 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms