Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cct3P80318 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cct3P80318 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cct3P80318 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cct3P80318 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cct3P80318 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms