Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Polr1bP70700 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1bP70700 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1bP70700 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms