Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sparcl1P70663 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms