Protein–RNA interactions for Protein: P70387

Hfe, Hereditary hemochromatosis protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HfeP70387 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HfeP70387 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HfeP70387 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HfeP70387 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HfeP70387 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HfeP70387 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HfeP70387 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HfeP70387 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HfeP70387 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HfeP70387 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HfeP70387 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HfeP70387 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HfeP70387 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HfeP70387 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HfeP70387 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HfeP70387 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HfeP70387 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HfeP70387 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HfeP70387 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HfeP70387 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HfeP70387 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HfeP70387 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms