Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smad1P70340 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smad1P70340 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad1P70340 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad1P70340 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms