Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkn1P70268 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkn1P70268 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkn1P70268 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms