Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Chl1P70232 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Chl1P70232 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Chl1P70232 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chl1P70232 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chl1P70232 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chl1P70232 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chl1P70232 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chl1P70232 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chl1P70232 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 499.6 ms