Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Traf6P70196 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf6P70196 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf6P70196 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms