Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lrig1P70193 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig1P70193 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig1P70193 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms