Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf5P70191 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf5P70191 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf5P70191 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf5P70191 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Traf5P70191 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms