Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbdsP70122 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SbdsP70122 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SbdsP70122 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbdsP70122 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SbdsP70122 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SbdsP70122 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SbdsP70122 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SbdsP70122 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms