Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crabp1P62965 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Crabp1P62965 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Crabp1P62965 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms