Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhobP62746 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhobP62746 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhobP62746 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhobP62746 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhobP62746 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhobP62746 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhobP62746 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhobP62746 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhobP62746 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhobP62746 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhobP62746 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhobP62746 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhobP62746 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhobP62746 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhobP62746 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhobP62746 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms