Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm5P62322 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm5P62322 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms