Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnrpeP62305 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpeP62305 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms