Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrch1P62046 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrch1P62046 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrch1P62046 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms