Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ufm1P61961 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ufm1P61961 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms