Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itga11P61622 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itga11P61622 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itga11P61622 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga11P61622 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga11P61622 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga11P61622 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga11P61622 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga11P61622 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga11P61622 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga11P61622 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga11P61622 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms