Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2kP61087 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2kP61087 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2kP61087 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms