Protein–RNA interactions for Protein: P60882

Megf8, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 2,789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf8P60882 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Megf8P60882 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Megf8P60882 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Megf8P60882 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms