Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hps5P59438 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps5P59438 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hps5P59438 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps5P59438 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms