Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fermt1P59113 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fermt1P59113 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fermt1P59113 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms