Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P58686 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P58686 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P58686 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P58686 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P58686 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P58686 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P58686 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P58686 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P58686 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms