Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp25P57080 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp25P57080 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp25P57080 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp25P57080 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp25P57080 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms