Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PmchP56942 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PmchP56942 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PmchP56942 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PmchP56942 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PmchP56942 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PmchP56942 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PmchP56942 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PmchP56942 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PmchP56942 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms