Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lim2P56563 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lim2P56563 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lim2P56563 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lim2P56563 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms