Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irf5P56477 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irf5P56477 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irf5P56477 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irf5P56477 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf5P56477 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf5P56477 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irf5P56477 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf5P56477 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irf5P56477 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irf5P56477 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms