Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp5P56399 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp5P56399 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp5P56399 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp5P56399 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp5P56399 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp5P56399 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms