Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dsc2P55292 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dsc2P55292 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dsc2P55292 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms