Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb4P54761 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ephb4P54761 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb4P54761 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms