Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux1P53564 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cux1P53564 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cux1P53564 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux1P53564 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux1P53564 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux1P53564 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Cux1P53564 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux1P53564 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cux1P53564 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms