Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ube2e3P52483 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ube2e3P52483 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ube2e3P52483 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms