Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2e1P52482 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e1P52482 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e1P52482 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms