Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SqleP52019 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SqleP52019 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SqleP52019 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SqleP52019 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SqleP52019 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SqleP52019 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SqleP52019 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SqleP52019 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SqleP52019 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SqleP52019 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SqleP52019 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SqleP52019 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SqleP52019 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SqleP52019 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SqleP52019 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SqleP52019 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SqleP52019 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SqleP52019 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SqleP52019 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SqleP52019 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SqleP52019 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SqleP52019 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SqleP52019 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SqleP52019 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SqleP52019 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SqleP52019 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms