Protein–RNA interactions for Protein: P51954

Nek1, Serine/threonine-protein kinase Nek1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek1P51954 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek1P51954 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek1P51954 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek1P51954 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek1P51954 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms