Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec1P51908 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms