Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa6P50704 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa6P50704 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa6P50704 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa6P50704 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa6P50704 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa6P50704 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa6P50704 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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