Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gdi1P50396 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gdi1P50396 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gdi1P50396 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms