Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxc13P50207 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxc13P50207 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc13P50207 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms