Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpreP49446 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpreP49446 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtpreP49446 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpreP49446 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpreP49446 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms