Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atoh1P48985 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atoh1P48985 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atoh1P48985 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atoh1P48985 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms