Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptx3P48759 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptx3P48759 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptx3P48759 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms