Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brca1P48754 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Brca1P48754 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Brca1P48754 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Brca1P48754 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca1P48754 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca1P48754 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms