Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx1P48377 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rfx1P48377 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx1P48377 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms